擬南芥(Arabidopsis thaliana)是植物分子生物學，遺傳學和基因組學的長期建立的模式物種，并且擬南芥基因功能的研究為制定假設和設計涉及其他植物(包括經濟上重要的物種)的實驗提供了基礎。因此，了解擬南芥基因組以及對其相關基因表達的詳細和準確理解對于基礎研究和實際應用都非常重要。這一目標依賴于新的遺傳和基因組資源的開發(fā)，涉及新的數據采集和分析方法。
來自俄羅斯科學院的研究人員使用高通量轉錄組測序在這里展示了不同器官和發(fā)育階段的A.thaliana基因表達譜的全基因組分析。在79個器官和發(fā)育階段評估了25,706個蛋白質編碼基因的表達，以及它們的穩(wěn)定性和它們的時空特異性。尋找可變剪接事件確定了37,873個先前未報告的剪接點，其中約30%發(fā)生在基因間區(qū)域。這些可能代表TAIR10數據庫中未包含的新型剪接基因。
可用性 - 這些數據存放在基于網絡的開放式數據庫中，TraVA，可以顯示和分析基因表達譜和器官與發(fā)育階段之間的差異基因表達。
